抑制住里面大量N2爆弹的运作后，初号机下到最底层，拔出了用来禁锢莉莉丝身躯的朗基努斯之枪，并将莉莉丝剩下的半边身体吞噬掉了。
拿到朗基努斯之枪的初号机变得更为可怕，对自身AT力场和各种变化的控制能力也出现了飞跃，他甚至将亚当胚胎一口啃掉后还能抑制住自身的觉醒冲动。
之后的初号机就一直安静的待在NERV总部旁，已经被证实拥有亚当灵魂的渚薰和寄宿着莉莉丝灵魂的绫波丽被其严密监管控制着。
“真嗣、唯”
碇源堂在轨道车进入下一段隧道前深深地看了初号机一眼，明显保持着一定程度人类精神的初号机，早已在试探中被证实依旧由碇真嗣在控制，在初步交流中，初号机内碇唯的痕迹也得到确认
“你们在等待什么呢？”
初号机微微偏过脑袋，看了看湖边坐在石头上拿着鱼竿钓鱼灰发少年。
渚薰似乎并不担心自己的下场，哪怕手持朗基努斯之枪的初号机随时有可能将其轻易撕碎吞噬，他反而非常自来熟的和NERV的人交涉弄到不少东西来打发时间。
因为被司令抓包而在外面忙成狗的葛城美里刚刚回到总部，此刻正在旁边和研究员律子询问初号机的问题。
没有理会美里试探性的热情招呼，初号机转移视线，他的目光透过重重阻碍看了看NERV总部下层里，穿着病号服躺在医疗室内翻书的蓝发少女绫波丽，又往更深处打量了一下正在进行身体调养的一群三无蓝发少女——和绫波丽同期的其他克隆体。
最后他的目光扫过二号机停机坪，看了眼正在努力提高同步率的金发少女。
比起轮回中各种各样的悲惨结局，现在的情况已经很不错了，真嗣不敢奢求更多。
但这种幸福还能持续多久呢？
初号机抬头看了眼自己头上那一圈半透明的模糊光环，时刻不离朗基努斯之枪的右手手指微曲。
清理掉其他使徒和SEELE之后，已经过了很久了时间
“时间快到了啊.”渚薰喃喃了一句，放下手中没有任何收获的钓竿，回头打量着初号机。
感知敏锐的真嗣听到渚薰的话语，初号机将目光转到了灰发少年身上，巨人和少年对视了一眼，同时察觉到了对方的异样。
然而轮回的时限已经到了。
在一瞬间，亚当与莉莉丝的灵魂释放出无穷无尽的能量，它们寄宿的身体瞬间被蒸发，两道灵魂沿着四维狭缝瞬移到了它们融合在一起的身躯——初号机这边。
朗基努斯之枪仿若基因一般螺旋解体，仿佛植物根须一样侵蚀进了初号机的身体。
成为神化觉醒核心的真嗣拼命抑制自身的能量反应，但其身躯不受控制的转化为纯白的光芒，体型开始逐渐膨胀。
所有人类同时失去形体化为橙红色的