进行惩罚，反而好言安抚他们。称赞他们识大体、明忠义是好汉子。对于他们的过往既往不咎，鼓励他们安心服役争取荣立战功。这些官兵被感动的无以复加，纷纷跪在地上表示不负大人所望。
陈尚仁和王崇信两人对杨林处理逃兵的手段很是钦佩，虽然手段严厉了些可毕竟“慈不掌兵义不掌财”。军队要是没有严格的纪律约束那还是军队吗？因此他们也开始严厉整顿队伍，一切都向叆阳标营看齐。
在此期间他们向熊廷弼写了信，详细禀报了自己和经略标营在叆阳协防的情况。并请示经略标营是否还继续待在叆阳。朝廷给的命令虽然是继续协守叆阳，可自己这些人毕竟是经略大人的手下，这事必须要再请示一下。
熊廷弼很快回信，对经略标营在叆阳的表现很是满意，不免夸奖了一番。然后又从全局的角度告诉陈尚仁和王崇信，他们还要继续在叆阳呆上一段时间。在这段时间内要严格训练队伍不能松懈，服从杨林的指挥并搞好和友军的关系，防止后金军再度进犯。
陈尚仁和王崇信是实在人，他们遵循熊廷弼的话带领队伍严格训练，为后金军再次进犯做好准备。
三月上旬，杨林几经试验终于把方向机和高低机造了出来，并成功安装到了红夷大炮上面。虽然增加了将近二百斤的重量，但是通过实际操作火炮的准确性和射速并没受到不良影响，炮身的灵活性得到极大提高。
又过了几天杨林正打算继续肥皂的研制，熊廷弼派出的信使就到了，他们带来了一个不好的消息，虏军南下了。