大的，朱翊钧就得有所表态。例如去年他就安排中官往张居正家里送两幅大字，“壮老先生府邸声色”。如此一来，朝廷都知道张居正圣眷如故。
但是，朱翊钧留中、圈阅几本以后，这奏章还是雪片似来，即知道是保守势力开始第一波反击。朱翊钧本来想和张居正沟通一下，但看他几次小会提都不提。有点稳坐钓鱼台，八风不动的意思，朱翊钧也就按下心思，静观其变。
万历二年六月二十日，南京户科给事中余懋学的一篇奏章，为此次‘逆流’攻击中的高峰，集大成者，终于把稳稳的张居正和朱翊钧都撩拨恼了。
余懋学在奏章中“陈五事”，一曰崇惇大。余懋学直接攻击皇帝道：“陛下临御以来，立考成之典，复久任之规。申考宪之条，严迟限之罚，大小臣工鳃鳃奉职。然臣所过虑者，政严则苛，法密则扰，非所以培元气存大体也。昔皋陶以宽简赞帝舜，姬旦以惇大告成王。愿陛下远宪二君，留心柔克，持大体而略繁文，矜微瑕而宥小眚。”
这段话的大意就是，皇上你搞考成法太严了，大小臣工无法“培元气存大体”。余懋学还给朱翊钧举了两个正面例子：皋陶对臣下、人民很宽简，周公告诉成王施政要敦厚宽大。
余懋学想让皇帝怎么个敦厚宽大呢？余懋学道：“纶綍本之和平，而不数下切责之旨。政令依于忠厚而不专尚刻核之实......庶几宽严相济，政是以和。”大意是，皇上别老哔哔说（切责之旨）这个没完成，那个必须干好。大家都很努力，你老哔哔让臣工很难办的。你松一松，即所谓“宽严相济，政事以和”了。
二曰亲謇谔（按：正直之臣）。余懋学说：“言路通塞，治忽攸关。汉唐之主或止辇以受流涕太息之言，或齐威以容十渐十思之谏。”
而皇帝你登基以后，我朝如何呢？“戆直之臣，辄遭降斥！敢言之士，动致外迁！......愿陛下虚以受人言，求诸道无谓逆耳而加谴谪，无因小疪而加诘问。并乞申谕吏部优录忠谠无戆者。”
这段话余懋学赤裸的暗示皇帝，你被张居正耍了，他把敢言之士都从你身边赶开啦，赶紧让吏部把他们召回来。如此一来呢，“圣德日弘，而奸邪不敢窃肆。”
三曰慎名器。余懋学说，皇上你加恩宫臣太监郑真，得荫侄铉为锦衣卫千户，恩既渥矣。然后你就把握不住了，“未几辄求管事，未几辄求诰命，陛下未下部议俱允其请。”朱翊钧看见这段表示，那是李太后干的，扣我脑袋上干嘛？